A linha de pesquisa de “Sistemática e Macroevolução” têm por objetivo descrever e compreender a história evolutiva de espécies e grupos de espécies e a sua relação com a estrutura e desenvolvimento vegetativo e reprodutivo, com ênfase em angiospermas neotropicais ocorrentes do Brasil. De forma complementar, esses estudos são utilizados como subsídio às pesquisas em evolução, ecologia, fisiologia e taxonomia vegetal. Como produtos, ressaltam-se a organização e a disponibilização do conhecimento da biodiversidade vegetal através da realização de revisões taxonômicas, descrição de novas espécies e da elaboração de chaves de identificação e mapas de distribuição; a reconstrução da história de diversificação de táxons para identificação de fatores chave em eventos de especiação; elaboração de classificações mais estáveis; e teste de hipóteses sobre a evolução de caracteres e sobre processos determinantes para a ocupação de ambientes (i.e. biogeografia). Esses estudos integram dados em escala ecológica-evolutiva através de ferramentas de biologia comparada, como métodos filogenéticos e filogeográficos, e de modelagem experimental que podem fornecer bases concretas para o entendimento de padrões e processos da fitodiversidade em escala macroevolutiva, gerando uma base potencial para aplicações econômicas, indicando, por exemplo, plantas medicinais, alimentícias, forrageiras, com interesse paisagístico e para recuperação de áreas degradadas. Ressalta-se ainda o desenvolvimento de estudos em ensino e extensão na área de botânica com o fim de desenvolver materiais didáticos e a avaliação e implementação de ferramentas inovadoras de ensino e aprendizagem.