Nesta grande linha ou PPBV possui duas linhas de pesquisa:
– Biologia Molecular, Bioquímica e Fisiologia Vegetal
– Interação Planta-Ambiente e Fisiologia da Produção Vegetal

• A linha de pesquisa de “Biologia Molecular, Bioquímica e Fisiologia Vegetal” contempla o estudo dos processos gênicos e genômicos, bioquímicos e fisiológicos que atuam no crescimento e no desenvolvimento de plantas nativas e cultivadas no Brasil, especificamente os processos de fotossíntese, fotorrespiração, metabolismo de nitrogênio e fósforo, transporte de água, absorção e transporte de nutrientes e balanço hormonal. O desenvolvimento de metodologias relacionadas às áreas da biologia molecular, bioquímica e fisiologia vegetal estão incorporadas à área, com ênfase no desenvolvimento e treinamento de ferramentas em biologia computacional.